As Raízes
Tal como uma casa, o Bonsai necessita uma boas fundações. Tudo aquilo que você possa fazer para melhorar o vigor e o volume das raízes será refletido na parte visível da árvore. Uma estrutura forte, saudável da raiz é geralmente um combinado de, alimento e poda juntamente com um composto (terra) aberto e apropriado.
As raízes junto ao tronco devem ser expostas, isso dá aquela sensação de árvore adulta, poderosa bem ancorada á terra. Uma árvore jovem não passa de uma vara espetada no chão sem interesse visual. Este alargamento da raiz é chamado de ' Nebari '.